《北京大學學報(醫學版)》是由教育部主管、北京大學主辦、國內外公開發行的綜合性醫學學術性期刊(雙月刊)。主要報道醫學科學領域的最新研究成果，刊登具有國內外先進水平的基礎醫學、臨床醫學、預防醫學、生物醫學、藥學及與醫學有關的邊緣學科的高水平、高質量的研究論文。《學報》根據醫學領域研究的前沿或熱點課題及當前的重大疾病，每年組織2到4期重點專題。重點專題來稿均為國內各相關領域具有較大學術影響力的學科帶頭人的研究成果，基本反映了國內這些領域的研究水平。

　　《學報》自1959年創刊至今，經歷了3次更名。最初稱為《北京醫學院學報》，由北京醫學院主辦。1985年學校更名為北京醫科大學，學報也更名為《北京醫科大學學報》。2000年4月北京醫科大學與北京大學正式合并，并與同年的5月4日，正式更名為北京大學醫學部。隨著學校的更名，2001年《北京醫科大學學報》更名為《北京大學學報(醫學版)》，現任主編詹啟敏院士，編輯部主任曾桂芳。

　　入選項目：

　　中國科技期刊卓越行動計劃中文領軍期刊

　　被各檢索系統、數據庫收錄情況：

　　國外：美國國立醫學圖書館PubMed Central (PMC)、美國醫學文獻分析和聯機檢索系統(MEDLINE/PubMed)、美國EBSCO、美國化學文摘數據庫及其《化學文摘》(CA)、荷蘭《醫學文摘》(Embase)、荷蘭《文摘與引文數據庫》(Scopus)、波蘭《哥白尼索引》(ICI)、世界衛生組織西太平洋地區醫學索引(Western Pacific Region Index Medicus)、日本科學技術振興機構文獻數據庫(JSTChina)。

　　國內：中國科技論文與引文數據庫(CSTPCD)、中國科學引文數據庫(CSCD)、中國生物醫學文獻數據庫(CBM)、中文生物醫學期刊引文數據庫(CMCI)和《中文核心期刊要目總覽(2023年版)》核心期刊。也是《中國生物學文摘》收錄期刊。本刊全文入編萬方數據-數字化期刊群、中國學術期刊網絡出版總庫(CNKI)。

　　獲獎情況：

　　獲得中國高校科技期刊研究會2016和2018年度“中國高校杰出科技期刊獎”，2006年至2014年連續5屆榮獲“中國高校精品科技期刊獎”， 2013年、2015年榮獲“中國國際影響力優秀學術期刊獎”，2008年至2014年連續3屆入選“中國精品科技期刊”， 2009年榮獲“全國高校科技期刊優秀編輯質量獎”，2004年至2007年連續4屆和2018年入選“中國百種杰出學術期刊”， 2004年榮獲全國高校優秀科技期刊評比一等獎，1997年榮獲全國優秀科技期刊評比二等獎，1992年榮獲全國優秀科技期刊評比三等獎。

　　欄目設置：

　　主要欄目有：述評、專家筆談、論著、疑難/罕見病例分析、科研快報、重要進展簡報、技術方法、病例報告、短篇論著、工作綜述、綜述(特邀)、學科交叉。

　　另外還有：回顧與展望、院士論壇、海外學者論壇、專題報告、研究簡報、經驗交流、短篇報道、新技術應用、獲獎工作綜述、科研工作綜述、臨床病理討論、講座、網絡與醫學、文獻計量與分析、獲獎工作簡介、新當選院士、為人師表等。