《海軍軍醫大學學報》(原《第二軍醫大學學報》)是由海軍軍醫大學主管、海軍軍醫大學教研保障中心主辦，國內外公開發行的綜合性醫藥衛生類學術刊物，1980年6月創刊，2022年2月改為現刊名。

　　本刊為月刊，A4開本，80 g銅版紙彩色雙膠印刷。國內統一連續出版物號：CN 31-2187/R，國際標準連續出版物號：ISSN 2097-1338。本刊面向全國和海外作者征稿，主要報道基礎醫學、臨床醫學、預防醫學、軍事醫學、藥學和中醫學等領域的最新科研成果。由著名肝膽外科專家、國家最高科技獎獲得者吳孟超院士任主編。辟有院士論壇、中青年學者論壇、專家論壇、專題報道、論著、研究快報、綜述、學術園地、海洋軍事醫學、病例報告等欄目。讀者對象主要為從事醫藥衛生工作的中高級科研、醫療、教學、預防機構人員和高等醫藥學院校的師生。

　　本刊一直被《中文核心期刊要目總覽》確認為中國綜合性醫藥衛生類核心期刊，是中國科技論文統計源期刊、中國科學引文數據庫源期刊，被包括中國知網、萬方數據等在內的國內所有重要檢索系統收錄，并被荷蘭《醫學文摘》(EMBASE)、荷蘭斯高帕斯(Scopus)、美國《化學文摘》(CA)等國際知名檢索系統收錄。

　　自1980年以來，本刊先后多次獲全國、全軍、教育部和省、市優秀科技期刊評比一、二等獎，包括國家期刊獎百種重點期刊獎、國家期刊獎提名獎、全國高校精品科技期刊獎、全國高校優秀科技期刊評比一等獎、中國精品科技期刊、中國高校精品科技期刊獎、中國百種杰出學術期刊、中國高校百佳科技期刊等。