《南京師大學(xué)報(bào)（自然科學(xué)版）》曾獲得《CAJ-CD規(guī)范》執(zhí)行優(yōu)秀期刊獎(jiǎng)。

　　2004年，學(xué)報(bào)在全國(guó)高校科技期刊評(píng)比中獲得二等獎(jiǎng)、在第二屆江蘇期刊方陣評(píng)選中被評(píng)為優(yōu)秀期刊。