1、2008年，由吉林省省委宣傳部、省新聞出版局共同組織的第八次全省期刊等級(jí)評(píng)審中，玉米科學(xué)被評(píng)為“雙十佳”期刊。玉米科學(xué)被評(píng)為一級(jí)期刊，從一級(jí)期刊中分別評(píng)選出自然科學(xué)類和社會(huì)科學(xué)類雙十佳期刊，玉米科學(xué)被評(píng)為科技類十佳期刊。

2、2006年，在第五屆全國農(nóng)業(yè)期刊金犁獎(jiǎng)評(píng)選活動(dòng)中，玉米科學(xué)被評(píng)為學(xué)術(shù)類一等獎(jiǎng)。

3、2002年，玉米科學(xué)獲得第三屆全國優(yōu)秀農(nóng)業(yè)期刊獎(jiǎng)。

4、2009年1月，《玉米科學(xué)》獲得期刊精品獎(jiǎng)。吉林省新聞出版獎(jiǎng)是省政府2005年設(shè)立，是吉林省出版行業(yè)的最高獎(jiǎng)項(xiàng)。

5、在吉林省委宣傳部、吉林省新聞出版局組織的第九屆全省期刊等級(jí)評(píng)審中，玉米科學(xué)被評(píng)為一級(jí)期刊。在期刊等級(jí)評(píng)審的基礎(chǔ)上，從一級(jí)期刊中分別評(píng)出自然科學(xué)類和社會(huì)科學(xué)類吉林名刊34種，其中自然科學(xué)類15種，玉米科學(xué)被評(píng)為吉林名刊。

6、2009年8月24日，第三屆北方優(yōu)秀期刊評(píng)選活動(dòng)在遼寧省沈陽市進(jìn)行。此次中國北方優(yōu)秀期刊獎(jiǎng)評(píng)選活動(dòng)是繼2004年河北和2007年黑龍江舉辦的北方優(yōu)秀期刊評(píng)選活動(dòng)后第三屆，并更名為“中國北方優(yōu)秀期刊評(píng)選活動(dòng)”。此次評(píng)選活動(dòng)得到了各有關(guān)省、市、區(qū)新聞出版局的積極推動(dòng)和中國期刊協(xié)會(huì)的大力支持。有來自北京、天津、河北、山西、內(nèi)蒙古、吉林、黑龍江、寧夏、甘肅、青海、遼寧等11個(gè)省、市、區(qū)的219種期刊參加評(píng)選。參評(píng)期刊數(shù)量、涉及地區(qū)均超過歷屆。玉米科學(xué)獲中國北方優(yōu)秀期刊獎(jiǎng)。

7、由中國期刊評(píng)價(jià)委員會(huì)、武漢大學(xué)中國科學(xué)評(píng)價(jià)研究中心出版的《中國學(xué)術(shù)期刊評(píng)價(jià)研究報(bào)告》（2009-2010）中，《玉米科學(xué)》期刊被評(píng)為“RCCSE中國權(quán)威學(xué)術(shù)期刊".