1、2008年，由吉林省省委宣傳部、省新聞出版局共同組織的第八次全省期刊等級評審中，玉米科學被評為“雙十佳”期刊。玉米科學被評為一級期刊，從一級期刊中分別評選出自然科學類和社會科學類雙十佳期刊，玉米科學被評為科技類十佳期刊。

2、2006年，在第五屆全國農業期刊金犁獎評選活動中，玉米科學被評為學術類一等獎。

3、2002年，玉米科學獲得第三屆全國優秀農業期刊獎。

4、2009年1月，《玉米科學》獲得期刊精品獎。吉林省新聞出版獎是省政府2005年設立，是吉林省出版行業的最高獎項。

5、在吉林省委宣傳部、吉林省新聞出版局組織的第九屆全省期刊等級評審中，玉米科學被評為一級期刊。在期刊等級評審的基礎上，從一級期刊中分別評出自然科學類和社會科學類吉林名刊34種，其中自然科學類15種，玉米科學被評為吉林名刊。

6、2009年8月24日，第三屆北方優秀期刊評選活動在遼寧省沈陽市進行。此次中國北方優秀期刊獎評選活動是繼2004年河北和2007年黑龍江舉辦的北方優秀期刊評選活動后第三屆，并更名為“中國北方優秀期刊評選活動”。此次評選活動得到了各有關省、市、區新聞出版局的積極推動和中國期刊協會的大力支持。有來自北京、天津、河北、山西、內蒙古、吉林、黑龍江、寧夏、甘肅、青海、遼寧等11個省、市、區的219種期刊參加評選。參評期刊數量、涉及地區均超過歷屆。玉米科學獲中國北方優秀期刊獎。

7、由中國期刊評價委員會、武漢大學中國科學評價研究中心出版的《中國學術期刊評價研究報告》（2009-2010）中，《玉米科學》期刊被評為“RCCSE中國權威學術期刊".