本刊于1992、1996、2000、2004、2008、2011、2014、2017、2020和2023年連續10次入編《中文核心期刊要目總覽》（共10版），且2008和2011年在基礎醫學類排名第一。1988年入選首批中國科技核心期刊，之后歷年均入選，且2009~2021年12次在基礎醫學類綜合排名第一。2007~2020年13次榮獲“百種中國杰出學術期刊”獎。2008~2023年連續6屆入選“中國精品科技期刊”（共6屆）。2011、2013、2015、2017和2024年均被評為“RCCSE（武漢大學中國科學評價研究中心）中國權威學術期刊”。2016年中國（武漢）期刊交易博覽會榮獲“2016期刊數字影響力100強”（學術類期刊）稱號。2010年榮獲廣東省期刊評選最高獎——品牌期刊獎；2011年榮獲廣東省優秀科技期刊一等獎；2015、2017、2021和2024年被評為廣東省精品科技期刊；2022年獲得首屆廣東出版政府獎（期刊獎）。1997~2005年連續獲得中國科協優秀基礎性和高科技學術期刊專項經費資助；2010~2011、2013~2017年獲得中國科協精品科技期刊示范項目及期刊學術質量提升項目資助；2019~2024、2024~2028年連續獲得中國科技期刊卓越行動計劃；2021年獲得廣東省科技廳高水平科技期刊建設項目資助。本刊發表的7篇論文于2004~2008年連續5屆榮獲中國科協期刊優秀學術論文獎；2012~2024年149篇論文入選“中國精品科技期刊頂尖學術論文（領跑者5000）”。