2004年4月，創刊僅3年，就以影響因子0.47高起點進入科技部“中國科技論文統計源期刊”即“中國科技核心期刊”。

　　據2010年中國科技期刊引證報告(擴刊版)公布的數據，在1946種核心期刊中，《中國微創外科雜志》影響因子為0.952，他引率0.84，在75種外科類雜志中，本刊影響因子排10位，總被引頻次排第11位，這標志著本刊的學術影響力又上一個新臺階。